Родился в 1965 году в Кишинёве. В 1988 году закончил Московский государственный технический университет им. Н. Э. Баумана, в 1990 году аспирантуру этого университета, а в 2005 получил диплом MBA в Высшей школе экономики.

В 1991 году с своим компаньоном, Владимиром Прониным, основали компанию "Дженсер сервис", которая впоследствии превратилась в группу компаний Genser. Сначала занимался тем, что продавал перевезенные из Германии подержанные автомобили, затем вместе с компаньоном стал перегонять новые автомобили Saab из Вены. Далее начал открывать дилерские центры в Москве, первым из которых стал Saab. С 1992 по 2007 занимал должность финансового директора, а с 2007 и до своей смерти в 2010 году являлся председателем совета директоров Genser. Игорь Пономарев входил в рейтинг 1000 самых профессиональных менеджеров России по версии издательского дома Коммерсант. Стал победителем конкурса "Лучший риск-менеджер в России в 2006 году".Во многом благодаря его работе Genser оставалась привлекательной для инвестиций даже в период Кризиса.Был автором колонок для журнала Финанс, вел блог в ЖЖ. Являлся одним из 500 богатейших людей России, его состояние оценивалось в $70 млн.

19 января 2010 года в возрасте 44х лет, после продолжительной болезни Игорь Пономарев скончался.